Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms