Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK0

Tmem30a, Cell cycle control protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30aQ8VEK0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem30aQ8VEK0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem30aQ8VEK0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem30aQ8VEK0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms