Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Vps4aQ8VEJ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms