Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cul7Q8VE73 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cul7Q8VE73 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cul7Q8VE73 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cul7Q8VE73 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms