Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd49Q8VE42 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd49Q8VE42 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ankrd49Q8VE42 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd49Q8VE42 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd49Q8VE42 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd49Q8VE42 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd49Q8VE42 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd49Q8VE42 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd49Q8VE42 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms