Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy2Q8R4C2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy2Q8R4C2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy2Q8R4C2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms