Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc12Q8K5B8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms