Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q7

Cerk, Ceramide kinase, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerkQ8K4Q7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CerkQ8K4Q7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CerkQ8K4Q7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CerkQ8K4Q7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms