Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ncapd2Q8K2Z4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ncapd2Q8K2Z4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms