Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Depp1Q8K2F3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Depp1Q8K2F3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Depp1Q8K2F3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms