Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fcho1Q8K285 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fcho1Q8K285 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fcho1Q8K285 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fcho1Q8K285 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fcho1Q8K285 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcho1Q8K285 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms