Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacs1Q8K212 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pacs1Q8K212 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs1Q8K212 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacs1Q8K212 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.3 ms