Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1eQ8K202 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1eQ8K202 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms