Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx5Q8K1E0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx5Q8K1E0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx5Q8K1E0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms