Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam20aQ8CID3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms