Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rab11fip3Q8CHD8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Rab11fip3Q8CHD8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms