Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tshz3Q8CGV9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tshz3Q8CGV9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tshz3Q8CGV9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms