Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC4

Lsm14b, Protein LSM14 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm14bQ8CGC4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsm14bQ8CGC4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lsm14bQ8CGC4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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