Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hpf1Q8CFE2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Hpf1Q8CFE2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hpf1Q8CFE2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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