Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Pramef8Q8CE24 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Pramef8Q8CE24 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Pramef8Q8CE24 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Pramef8Q8CE24 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Pramef8Q8CE24 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Pramef8Q8CE24 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Pramef8Q8CE24 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef8Q8CE24 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Pramef8Q8CE24 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Pramef8Q8CE24 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Pramef8Q8CE24 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Pramef8Q8CE24 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Pramef8Q8CE24 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Pramef8Q8CE24 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef8Q8CE24 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms