Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc17Q8CE13 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc17Q8CE13 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc17Q8CE13 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms