Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fbxo43Q8CDI2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo43Q8CDI2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo43Q8CDI2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms