Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vcpip1Q8CDG3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vcpip1Q8CDG3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vcpip1Q8CDG3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms