Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ufl1Q8CCJ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ufl1Q8CCJ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ufl1Q8CCJ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms