Protein–RNA interactions for Protein: Q8C804

Spice1, Spindle and centriole-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spice1Q8C804 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spice1Q8C804 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spice1Q8C804 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spice1Q8C804 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms