Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp20Q8C6M1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp20Q8C6M1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp20Q8C6M1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
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