Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac7Q8C2B3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac7Q8C2B3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac7Q8C2B3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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