Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpcpd1Q8C0L9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gpcpd1Q8C0L9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gpcpd1Q8C0L9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms