Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Skor1Q8BX46 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Skor1Q8BX46 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skor1Q8BX46 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skor1Q8BX46 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms