Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU27

Ppm1m, Protein phosphatase 1M, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1mQ8BU27 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppm1mQ8BU27 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppm1mQ8BU27 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppm1mQ8BU27 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppm1mQ8BU27 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppm1mQ8BU27 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppm1mQ8BU27 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms