Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rccd1Q8BTU7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rccd1Q8BTU7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms