Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tcaf1Q8BNE1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Tcaf1Q8BNE1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcaf1Q8BNE1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf1Q8BNE1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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