Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E130116L18RikQ8BMV6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms