Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ9

Csgalnact1, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Csgalnact1Q8BJQ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csgalnact1Q8BJQ9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Csgalnact1Q8BJQ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csgalnact1Q8BJQ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csgalnact1Q8BJQ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csgalnact1Q8BJQ9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csgalnact1Q8BJQ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Csgalnact1Q8BJQ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csgalnact1Q8BJQ9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Csgalnact1Q8BJQ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csgalnact1Q8BJQ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csgalnact1Q8BJQ9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csgalnact1Q8BJQ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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