Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smarcal1Q8BJL0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarcal1Q8BJL0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcal1Q8BJL0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms