Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
D130040H23RikQ8BII3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms