Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rbfox3Q8BIF2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbfox3Q8BIF2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms