Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd4aQ8BIE6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmd4aQ8BIE6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmd4aQ8BIE6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms