Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1l4Q8BGJ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms