Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sptlc3Q8BG54 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sptlc3Q8BG54 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sptlc3Q8BG54 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms