Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim65Q8BFW4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim65Q8BFW4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim65Q8BFW4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim65Q8BFW4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms