Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Kdm5bQ80Y84 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Kdm5bQ80Y84 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5bQ80Y84 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms