Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Npm2Q80W85 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Npm2Q80W85 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Npm2Q80W85 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms