Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr2eQ80UW8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2eQ80UW8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms