Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPW1

Nexn, Nexilin, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NexnQ7TPW1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NexnQ7TPW1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NexnQ7TPW1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NexnQ7TPW1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NexnQ7TPW1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NexnQ7TPW1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NexnQ7TPW1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NexnQ7TPW1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NexnQ7TPW1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NexnQ7TPW1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NexnQ7TPW1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NexnQ7TPW1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms