Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700010I14RikQ7TPG0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700010I14RikQ7TPG0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700010I14RikQ7TPG0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700010I14RikQ7TPG0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms