Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp397Q7TNK4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zfp397Q7TNK4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms