Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sys1Q78S06 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sys1Q78S06 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms