Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usmg5Q78IK2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usmg5Q78IK2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms