Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GypcQ78HU7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GypcQ78HU7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GypcQ78HU7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms